RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	APCS	P02743	223 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	AMT	P48728	403 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZR54	194 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	FRZB	Q92765	325 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744		I3L3M4	83 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TSHB	P01222	138 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	NIT1	Q86X76	327 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2L6	O14933	153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TCAP	O15273	167 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R17	O96001	155 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	FCER1G	P30273	86 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744		Q8N976	141 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744		Q9HAA7	133 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087WX48	190 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	VCY	O14598	125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	PPBP	P02775	128 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	MT-ND6	P03923	174 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	RBX1	P62877	108 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	COX19	Q49B96	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	PHOX2A	O14813	284 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	RTL8C	O15255	209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	FGF6	P10767	208 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ESD	P10768	282 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		Q8N8P6	123 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	COLCA2	A8K830	154 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	CRP	P02741	224 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	RAB5A	P20339	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PKIA	P61925	76 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TRGC2	P03986	189 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TNP2	Q05952	138 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PSCA	O43653	123 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	S100A1	P23297	94 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	REG3A	Q06141	175 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	LAGE3	Q14657	143 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZUT4	128 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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