RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRB-209ENST00000550857 REG3GQ6UW15 175 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRB-209ENST00000550857 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-209ENST00000550857 J3QL48 77 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H2BKO60814 126 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H2BJP06899 126 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H2BOP23527 126 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H2BBP33778 126 aa5.89□□□□□ -1.47
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