RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 F8VRH5 84 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 CRYBA4P53673 196 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DEFA6Q01524 100 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PMVKQ15126 192 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 CST9LQ9H4G1 147 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DEFB130BP0DP73 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DEFB130AP0DP74 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PLNP26678 52 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 STPG4Q8N801 248 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 Q8NAQ8 132 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 C14orf144Q96I85 54 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE12JA6NER3 117 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 G3V4G9 280 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 COX8AP10176 69 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE1Q13065 139 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE4Q13068 117 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE5Q13069 117 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE13Q4V321 117 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 DLEU1O43261 78 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 LINC00694P0DN24 101 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 VCX2Q9H322 139 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 ATRQ13535 2644 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 H7C423 109 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 FAM104AQ969W3 186 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 AMELXQ99217 191 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 PRO0255Q9UI72 69 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 DAD1P61803 113 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 NFE4Q86UQ8 179 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 NACAE9PAV3 2078 aa6.86□□□□□ -1.31
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CS-209ENST00000547449 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 M0R143 59 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 DEFB4AO15263 64 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SIVA1O15304 175 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 ATP5G1P05496 136 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 FGF6P10767 208 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 CTAG1AP78358 180 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 MDFIQ99750 246 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 C11orf86A6NJI1 115 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 PAX4O43316 350 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TMEM243Q9BU79 118 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 E9PLD3 99 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 GYPEP15421 78 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 NMUP48645 174 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 CELA1Q9UNI1 258 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-209ENST00000547449 HERVK_113P61574 105 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 PCP2Q8IVA1 136 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 A0A0J9YXV3 536 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 TIRAPP58753 221 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-209ENST00000547449 C12orf74Q32Q52 190 aa6.82□□□□□ -1.32
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