RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 MUC7Q8TAX7 377 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 SERF1AO75920 110 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TSHBP01222 138 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 G0S2P27469 103 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TIRAPP58753 221 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 LAGE3Q14657 143 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 HSBP1O75506 76 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 AMTP48728 403 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TMEM18Q96B42 140 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 LINC01549A6NIU2 74 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 TMEM243Q9BU79 118 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 ESDP10768 282 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 LINC00310P59036 64 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 LELP1Q5T871 98 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-218ENST00000538020 UBE2L6O14933 153 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 HBDP02042 147 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 CCL18P55774 89 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 APLNQ9ULZ1 77 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.27□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 H7C423 109 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 PKIAP61925 76 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.26□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 C3orf84H3BNL1 204 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 NUPR1O60356 82 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 PMCHL1Q16048 86 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 ESRGQ1W209 222 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TOMM6Q96B49 74 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 S100A2P29034 98 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 A0A096LNJ9 63 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 C5orf52A6NGY3 159 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TMEM262E9PQX1 116 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 ATP5LO75964 103 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 LEPROTL1O95214 131 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 FGF6P10767 208 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 GAGE6Q13070 117 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TMEM101Q96IK0 257 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 TIMM17AQ99595 171 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-218ENST00000538020 A0A087WX48 190 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 NPSP0C0P6 89 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 CASC10Q5T4H9 136 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 ERASQ7Z444 233 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 TMEM141Q96I45 108 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 UPK3BQ9BT76 320 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 A0A1B0GUV1 79 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZN92 141 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 TGP01266 2768 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGIPA6NJ69 53 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 SIVA1O15304 175 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 FABP4P15090 132 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 RBX1P62877 108 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 MPV17L2Q567V2 206 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.17□□□□□ -1.1
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