RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 FBXL15Q9H469 300 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GWB2 263 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 TMEM238C9JI98 176 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 E9PLD3 99 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 H0Y8G0 127 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 BUB3O43684 328 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 ZNF138P52744 262 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 C20orf78Q9BR46 151 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.87□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 ODF3BA8MYP8 253 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 M0R381 172 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-48P01763 117 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 PRSS1P07477 247 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 LAGE3Q14657 143 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 Q6ZVH6 145 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 CEND1Q8N111 149 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 SIGMAR1Q99720 223 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 A0A087WX48 190 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 H7C1H1 209 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 SNAI2O43623 268 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 BRI3O95415 125 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 NCR2O95944 276 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 NPYP01303 97 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 LEPP41159 167 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 NMUP48645 174 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 Q8N6K4 173 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 RNF185Q96GF1 192 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GV72 72 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 TMEM213A2RRL7 107 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 ORM1P02763 201 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 TCTAP57738 103 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-216ENST00000537568 FAT1Q14517 4588 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 F8VRH5 84 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 H3BUX3 64 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 M0QXV9 152 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 M0R3E3 92 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 CTSGP08311 255 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 CD24P25063 80 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 CNTFRP26992 372 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 LY6EQ16553 131 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 LINC00477Q96M19 166 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.83□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PRD5 423 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PRF3 423 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PRM7 423 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 OR11H12B2RN74 326 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 IGLL5B9A064 214 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 ECSCRQ19T08 205 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 RRN3P1Q2M238 152 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 PCP2Q8IVA1 136 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 OR11H1Q8NG94 326 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 OR11H2Q8NH07 326 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 METTL26Q96S19 204 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 ZNF702PQ9H963 129 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.82□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 H3BMG7 143 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 OVOL1O14753 267 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 NPFFO15130 113 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 COX7A1P24310 79 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 C12orf74Q32Q52 190 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 Q8N2B8 174 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TOMM6Q96B49 74 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 Q9HAA7 133 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 A0A087WW49 117 aa5.8□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.8□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 FAM223BA6NKX1 122 aa5.8□□□□□ -1.48
LMO3-216ENST00000537568 H3BUA1 57 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms