RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE2CQ5TA81 110 aa5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP35Q8NFH5 326 aa5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.9□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTCP35070 178 aa5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1HP80294 61 aa5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSKUQ8WUA8 353 aa5.89□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFC1BP0CG36 223 aa5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COTL1Q14019 142 aa5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.88□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX7O00628 323 aa5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAG3L2P0CL84 134 aa5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAG3L3P0CL85 134 aa5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2G2P60604 165 aa5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIQKQ629K1 86 aa5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPXA8MT69 81 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YIZ8 118 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF861PO60384 105 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIX6O95475 246 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSHBP01222 138 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MALP21145 153 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB24Q969Q5 203 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP1S3Q96PC3 154 aa5.86□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL2L11O43521 198 aa5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASL11AQ6T310 242 aa5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.85□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0QXV9 152 aa5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2G1P62253 170 aa5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WFDC1Q9HC57 220 aa5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNAI2O43623 268 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXorf1O96002 111 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A5P33763 92 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SS18Q15532 418 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE2EQ4V326 116 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZNX1 250 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPPP3Q9BW30 176 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIT2Q9NQR4 276 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPB11Q9Y547 144 aa5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PRE2 83 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5AL1P0C617 328 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFA1P59665 94 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF151Q2KHN1 245 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTF3L4Q96K17 158 aa5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTF3P20783 257 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FMC1Q96HJ9 113 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM101Q96IK0 257 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT15Q9NV35 164 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R2T5 61 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX7A2LO14548 114 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LTAP01374 205 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf48Q96LS8 159 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED28Q9H204 178 aa5.8□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APCSP02743 223 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESDP10768 282 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG11BQ08648 103 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf38Q86SI9 138 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM74A7A6NL05 159 aa5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMMP2LQ96T52 175 aa5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H7C423 109 aa5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCL1P09341 107 aa5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf25Q5T742 122 aa5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G10O15496 165 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL7P13232 177 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V0CP27449 155 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1C3P42330 323 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC160A6NGH7 325 aa5.75□□□□□ -1.49
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