RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 A0A087WX48 190 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 CAMPP49913 170 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 IQCJQ1A5X6 159 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MRAP2Q96G30 205 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.83□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 PKHD1P08F94 4074 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 GAS8-AS1O95177 125 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 S100A8P05109 93 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 PKIAP61925 76 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 HBBP68871 147 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 Q9HAA7 133 aa9.82□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.81□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM262E9PQX1 116 aa9.81□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.81□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.81□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 PHOX2AO14813 284 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MT-ND6P03923 174 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TRGC2P03986 189 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 COTL1Q14019 142 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MPV17L2Q567V2 206 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 KLK12Q9UKR0 248 aa9.8□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 SMKR1H3BMG3 65 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 NCR2O95944 276 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 HLA-DQA1P01909 254 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE6Q13070 117 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM243Q9BU79 118 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 ST20Q9HBF5 79 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 PPP1R17O96001 155 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 AMTP48728 403 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 RBX1P62877 108 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 NRACQ8N912 160 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 Q8N976 141 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TSTA3-208ENST00000528920 I3L3M4 83 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PMCHP20382 165 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2WQ96B02 151 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 TM2D2Q9BX73 214 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PKD1P98161 4303 aa9.77□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 A0A087WTM6 91 aa9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PSCAO43653 123 aa9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 APCSP02743 223 aa9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.76□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 TSHBP01222 138 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 CKS2P33552 79 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 RAB5BP61020 215 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 Q0VG73 95 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 RMI2Q96E14 147 aa9.75□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GUV1 79 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 VCYO14598 125 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 UBE2L6O14933 153 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 EREGO14944 169 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ENHOQ6UWT2 76 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 COX11Q9Y6N1 276 aa9.74□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 D6R8Y8 96 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BKO60814 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 CRPP02741 224 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PPBPP02775 128 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BJP06899 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BOP23527 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BBP33778 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BDP58876 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP10-2P60368 255 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BCP62807 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 C20orf78Q9BR46 151 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 PRR34Q9NV39 138 aa9.73□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 H7C423 109 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 TNFRSF6BO95407 300 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 ESDP10768 282 aa9.72□□□□□ -0.85
TSTA3-208ENST00000528920 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.8 ms