RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 GCGP01275 180 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2D-28P01615 120 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 UCHL1P09936 223 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYYP10082 97 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYL9P24844 172 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2G2P60604 165 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCS1P62166 190 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMCO1Q147U7 214 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXN5Q5MJ07 72 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PATE2Q6UY27 113 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZNX1 250 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRARPQ7Z6K4 114 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q86TA4 180 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB107AQ8IZN7 70 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00469Q8N7U9 141 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMED6Q8WW62 240 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00167Q96N53 147 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUNDC2Q9BWH2 189 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABARAPL3Q9BY60 117 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYTL1Q9NRR1 136 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0G2JQZ4 141 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFCAB10A6NFE3 127 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 AQP12BA6NM10 295 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFITM5A6NNB3 132 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOTOA8MTQ0 251 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf196B1AJZ1 125 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 B4DEV8 164 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BP45 60 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EQM0 130 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FKBP6O75344 327 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 APCSP02743 223 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1BP07438 61 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGPP08493 103 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBEAP1P0C6P0 100 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARMS2P0C7Q2 107 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 UCP3P55916 312 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RND3P61587 244 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RANP62826 216 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL32P62910 135 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA1644Q3SXP7 199 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMUG1Q53HV7 270 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf38Q86SI9 138 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKAP14Q86UN6 197 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 AQP12AQ8IXF9 295 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PACRGLQ8N7B6 248 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUDT10Q8NFP7 164 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUDT11Q96G61 164 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 XAGE1AQ9HD64 81 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF727A8MUV8 499 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHGR1C9JFL3 82 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 H7C423 109 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR7C2O60412 319 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5AL1P0C617 328 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCGR1AP12314 374 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 HRES1P13985 223 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB3BP20337 219 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF7P21781 194 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL12P30050 165 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMLGP49069 296 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTF1Q16619 201 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAL1Q4LDG9 190 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf25Q5T742 122 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXN1Q5VSR9 72 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAGE2AQ6NT46 116 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q75L30 129 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL17AQ8IVW1 177 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5C1Q8NGR4 320 aa0.85□□□□□ -2.27
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPX8Q8TED1 209 aa0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.3 ms