RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516208.1

RNU6-1194P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1194, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1194P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MED23Q9ULK4 1368 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 A2MP01023 1474 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 YPEL1O60688 119 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PITX3O75364 302 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CDKN2CP42773 168 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 COTL1Q14019 142 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMED2Q15363 201 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SMIM20Q8N5G0 67 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 OR13C6PQ8NH95 151 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MED31Q9Y3C7 131 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LAMA3Q16787 3333 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADGRB1O14514 1584 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LRRC37A3O60309 1634 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NCR2O95944 276 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM107AO95990 144 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TCRAP04437 139 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCL18P55774 89 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MT1HP80294 61 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PHB2Q99623 299 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MRC1P22897 1456 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PXDNQ92626 1479 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 REV3LO60673 3130 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRANK1O15050 2925 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PRDM2Q13029 1718 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM92AA1XBS5 289 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GNG3P63215 75 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM24BQ8N5W8 94 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DYDC1Q8WWB3 177 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KDM5CP41229 1560 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 J3QLW9 94 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NIPSNAP2O75323 286 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IFNA17P01571 189 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RBP4P02753 201 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 COX8AP10176 69 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HSD11B1P28845 292 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TCTAP57738 103 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PSPHP78330 225 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 COX17Q14061 63 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LINC01545Q5VT33 79 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 Q6JHZ5 121 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 THEM6Q8WUY1 208 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PPP1R14BQ96C90 147 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCDC32Q9BV29 185 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RPRMQ9NS64 109 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NDUFA12Q9UI09 145 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 APLNQ9ULZ1 77 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ITPR2Q14571 2701 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MTORP42345 2549 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 E7EQ34 232 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 M0R135 149 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IFNGP01579 166 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HLA-DRB4P13762 266 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM78Q5T7P6 136 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BOLA2Q9H3K6 86 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 R4GMQ9 66 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MYH6P13533 1939 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 AMELXQ99217 191 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HMGXB3Q12766 1538 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CEP290O15078 2479 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ITPR1Q14643 2758 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PFDN1O60925 122 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MT-ND4LP03901 98 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCL8P80075 99 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DEFA5Q01523 94 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 USMG5Q96IX5 58 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CFAP53Q96M91 514 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 373.1 ms