RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	BCL2L11	O43521	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	COTL1	Q14019	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	AMT	P48728	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	GNG4	P50150	75 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	CCL20	P78556	96 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	PHOX2A	O14813	284 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	IFNA1	P01562	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	NTF3	P20783	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	C15orf56	Q8N910	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	COX6A2	Q02221	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	PDE6D	O43924	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	NCR2	O95944	276 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	CTRL	P40313	264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618		H7C423	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	TWIST1	Q15672	202 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	STPG4	Q8N801	248 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	APCS	P02743	223 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618		Q6ZNX1	250 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	BCL2	P10415	239 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	FGF6	P10767	208 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A096LNI7	61 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	FOXI1	Q12951	378 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A0J9YXV3	536 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618		I3L3M4	83 aa		11	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	XCL1	P47992	114 aa		11	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	PMCH	P20382	165 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618		Q6ZRP5	223 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	CCL25	O15444	150 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618		K7EN84	100 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	SS18	Q15532	418 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	ESD	P10768	282 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.96	□□□□□ -0.65	9e-18	■■■■■ 56
SPATA20-223	ENST00000513618	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SPATA20-223	ENST00000513618	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.96	□□□□□ -0.65

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