RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q9HAA7	133 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.53	□□□□□ -0.56
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A087WTM6	91 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		F8W036	122 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	COTL1	Q14019	142 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A8	P05109	93 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP10-2	P60368	255 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	HBB	P68871	147 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	NCR2	O95944	276 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBX1	P62877	108 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE6	Q13070	117 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	NRAC	Q8N912	160 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8N976	141 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1B0GUV1	79 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		I3L3M4	83 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP1R17	O96001	155 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	AMT	P48728	403 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q0VG73	95 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	IMMP2L	Q96T52	175 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSCA	O43653	123 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	EREG	O14944	169 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	PMCH	P20382	165 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131	RMI2	Q96E14	147 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP2-223	ENST00000512131		H7C423	109 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSHB	P01222	138 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	APCS	P02743	223 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ESD	P10768	282 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	VCY	O14598	125 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CKS2	P33552	79 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIA	Q16674	131 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2L6	O14933	153 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRP	P02741	224 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPBP	P02775	128 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131		D6R8Y8	96 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHOX2A	O14813	284 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	WFDC2	Q14508	124 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	REG3A	Q06141	175 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8N814	137 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPY	P01303	97 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	FGF6	P10767	208 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHEB	Q15382	184 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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