RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCXQ7RTU7 201 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GATD1Q8NB37 220 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEBPGP53567 150 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAT1Q14517 4588 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS1P07477 247 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BORCS7Q96B45 105 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCR2O95944 276 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01551Q86U37 167 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM210AQ96ND0 272 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM231BA6NCW3 169 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF727A8MUV8 499 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H7C423 109 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSKUQ8WUA8 353 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1B0GUT8 65 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSTCQ9NRP0 149 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HIGD1CA8MV81 97 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 hDV102S1A0JD36 115 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 I3L3M4 83 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APCSP02743 223 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PMCHP20382 165 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP161Q6P656 301 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 J3QL48 77 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGF6P10767 208 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRAP2Q96G30 205 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ST20Q9HBF5 79 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIGQ13278 110 aa9.74□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BTF3L4Q96K17 158 aa9.74□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1B0GVG6 124 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R17O96001 155 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB4AP20338 218 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM101Q96IK0 257 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 V9GYV3 84 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ISOC2Q96AB3 205 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF185Q96GF1 192 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSHBP01222 138 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ESDP10768 282 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEA15Q15121 130 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AMN1Q8IY45 258 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP35Q8NFH5 326 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HERC1Q15751 4861 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYCBP2O75592 4640 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VCYO14598 125 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAS8-AS1O95177 125 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLPIP03973 132 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C15orf56Q8N910 161 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPH3Q96FX2 82 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAT8Q9UHE5 227 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.69□□□□□ -0.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PANO1I0J062 215 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms