RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC01549A6NIU2 74 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLLNB2CW77 178 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR11H12B2RN74 326 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNRH2O43555 120 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB131AP59861 70 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB1P60022 68 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBX1P62877 108 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 STHQ8IWL8 128 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.09□□□□□ -1.75
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB37Q96AX2 223 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 CST9LQ9H4G1 147 aa4.09□□□□□ -1.75
ARHGEF3-215ENST00000498517 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PPM0 123 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPRY2O43597 315 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 FABP2P12104 132 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEND1Q8N111 149 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR11H2Q8NH07 326 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TM2D2Q9BX73 214 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSTL1Q9H114 145 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.08□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SORL1Q92673 2214 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0J9YX75 114 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 B5MCH6 92 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 K7ERU9 68 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 VCYO14598 125 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV3-20P01619 116 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD7P09564 240 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 FXYD2P54710 66 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00315P59091 139 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 BAALCQ8WXS3 180 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM141Q96I45 108 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 KNCNA6PVL3 124 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 E9PLD3 99 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 F5H697 171 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCP4P48539 62 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 HERVK_113P61574 105 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 C9orf85Q96MD7 179 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 HIST1H4GQ99525 98 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.06□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 H3BMM0 161 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 K7ERJ3 54 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 PMVKQ15126 192 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 C12orf74Q32Q52 190 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIMM17AQ99595 171 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIR2DL4Q99706 377 aa4.05□□□□□ -1.76
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A087WWL8 130 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1B0GWB2 263 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGIPA6NJ69 53 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF815PA8K554 130 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLL5B9A064 214 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHOHQ15669 191 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF56Q15929 161 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF479Q96JC4 524 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC01587Q99440 93 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 JPT2Q9H910 190 aa4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGRNO00468 2067 aa4.04□□□□□ -1.76
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