RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246		H7C423	109 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	LECT2	O14960	151 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	REG3A	Q06141	175 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-231	ENST00000496246	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246		F8W036	122 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21	9e-9	■□□□□ 8.9
TTLL3-231	ENST00000496246	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	EPM2A	B3EWF7	344 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FCER1G	P30273	86 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8N1X5	172 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246		V9GYV3	84 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TCAP	O15273	167 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	VCY	O14598	125 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB4A	P20338	218 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMP	P49913	170 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	CKS2	P33552	79 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF6	P10767	208 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	HBB	P68871	147 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	HERC2	O95714	4834 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246		C9JQL5	133 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PPBP	P02775	128 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	WFDC2	Q14508	124 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SS18	Q15532	418 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	XG	P55808	180 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB5A	P20339	215 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246		Q5VSD8	79 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SMKR1	H3BMG3	65 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PHOX2A	O14813	284 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL25	O15444	150 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TSHB	P01222	138 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ORMDL3	Q8N138	153 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246		D6R8Y8	96 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF6B	O95407	300 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22

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