RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	PIGY	Q3MUY2	71 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	PAPPA	Q13219	1627 aa		-1.84	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	SDF2	Q99470	211 aa		-1.84	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		-1.84	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	-1.84	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	CMPK1	P30085	196 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	CCL18	P55774	89 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	ITPR3	Q14573	2671 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952		A6NIN4	97 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	S100G	P29377	79 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	SMPX	Q9UHP9	88 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1B0GV72	72 aa		-1.87	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	IFNA17	P01571	189 aa		-1.87	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	KLK9	Q2XQG4	91 aa		-1.87	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		-1.87	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	-1.87	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	RYR1	P21817	5038 aa		-1.88	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	SCT	P09683	121 aa		-1.88	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		-1.88	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC37A3	O60309	1634 aa		-1.88	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	RYR3	Q15413	4870 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952		M0R135	149 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGEF10	O15013	1369 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		-1.9	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1B0GX51	115 aa		-1.9	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952		H0YJX3	145 aa		-1.9	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	SPINK4	O60575	86 aa		-1.9	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	PPP1R17	O96001	155 aa		-1.9	□□□□□ -2.71
TTC3-222	ENST00000491952	PITX3	O75364	302 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952		R4GMQ9	66 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	TACC2	O95359	2948 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	NCS1	P62166	190 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952		Q6JHZ5	121 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM2	Q13029	1718 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	PBRM1	Q86U86	1689 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	MRC1	P22897	1456 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	FABP1	P07148	127 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	SAR1A	Q9NR31	198 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	TNF	P01375	233 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	IL5	P05113	134 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	CBLN1	P23435	193 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJC13	O75165	2243 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	CENPH	Q9H3R5	247 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	MUC17	Q685J3	4493 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	DAPK1	P53355	1430 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	CCL8	P80075	99 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	DEFB123	Q8N688	67 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	-1.97	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	-1.97	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952		Q6ZUT4	128 aa		-1.97	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	GINS2	Q9Y248	185 aa		-1.97	□□□□□ -2.72
TTC3-222	ENST00000491952	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		-1.98	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	DDA1	Q9BW61	102 aa		-1.98	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	SEC11C	Q9BY50	192 aa		-1.98	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		-1.98	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	DOCK1	Q14185	1865 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	MYH8	P13535	1937 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	TSTD3	H0UI37	97 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	IGLC6	P0CF74	106 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	HTT	P42858	3142 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	ADGRB1	O14514	1584 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	PXDN	Q92626	1479 aa		-2	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	SNCG	O76070	127 aa		-2	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC153	Q494R4	210 aa		-2	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		-2	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	SPTSSA	Q969W0	71 aa		-2	□□□□□ -2.73
TTC3-222	ENST00000491952	AMELX	Q99217	191 aa		-2	□□□□□ -2.73

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