RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487507.1

SGIP1-212, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SGIP1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-212ENST00000487507 APOMO95445 188 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 ISOC2Q96AB3 205 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.15□□□□□ -1.26
SGIP1-212ENST00000487507 CFC1BP0CG36 223 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 MT1HP80294 61 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 NUP35Q8NFH5 326 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.14□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 M0QY20 66 aa7.13□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 GCHFRP30047 84 aa7.13□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 IL15RAQ13261 267 aa7.13□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 TSKUQ8WUA8 353 aa7.13□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 BTCP35070 178 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 COTL1Q14019 142 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.12□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 PEX7O00628 323 aa7.1□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.1□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 AP1S3Q96PC3 154 aa7.1□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 STAG3L2P0CL84 134 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 STAG3L3P0CL85 134 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 MALP21145 153 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 UBE2G2P60604 165 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 TRIQKQ629K1 86 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SGIP1-212ENST00000487507 M0QXV9 152 aa7.08□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 BCL2L11O43521 198 aa7.08□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 ZNF861PO60384 105 aa7.08□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 TSHBP01222 138 aa7.08□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 RASL11AQ6T310 242 aa7.08□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 H0YIZ8 118 aa7.07□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 SIX6O95475 246 aa7.07□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.07□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 RAB24Q969Q5 203 aa7.07□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 CENPXA8MT69 81 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 SNAI2O43623 268 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 UBE2G1P62253 170 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 SS18Q15532 418 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 GAGE2EQ4V326 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.06□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 DEFA1P59665 94 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 RNF151Q2KHN1 245 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 Q6ZNX1 250 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 TPPP3Q9BW30 176 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 WFDC1Q9HC57 220 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 NIT2Q9NQR4 276 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 HSPB11Q9Y547 144 aa7.05□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 CXorf1O96002 111 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 S100A5P33763 92 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.04□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 A0A1W2PRE2 83 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 M0R2T5 61 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 OR5AL1P0C617 328 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 BTF3L4Q96K17 158 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 MED28Q9H204 178 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 SSPOA2VEC9 5147 aa7.03□□□□□ -1.28
SGIP1-212ENST00000487507 NTF3P20783 257 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 FMC1Q96HJ9 113 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM101Q96IK0 257 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 C2orf48Q96LS8 159 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 NUDT15Q9NV35 164 aa7.02□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 COX7A2LO14548 114 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 APCSP02743 223 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 SPAG11BQ08648 103 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.01□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 LTAP01374 205 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 ESDP10768 282 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 CNPY1Q3B7I2 92 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 C5orf38Q86SI9 138 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 USH2AO75445 5202 aa7□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 PRSS47A8MTI9 375 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 CXCL1P09341 107 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 IMMP2LQ96T52 175 aa6.99□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 FAM74A7A6NL05 159 aa6.98□□□□□ -1.29
SGIP1-212ENST00000487507 H7C423 109 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms