RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	DLX6	P56179	175 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	HERVK_113	P63121	156 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CXCL6	P80162	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF56	Q15929	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LINC00643	Q86TS7	51 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	METTL26	Q96S19	204 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CCL13	Q99616	98 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DMD	P11532	3685 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	MYO7A	Q13402	2215 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TECTA	O75443	2155 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	MYO9B	Q13459	2157 aa		2.77	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	RTTN	Q86VV8	2226 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	FRYL	O94915	3013 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LST1	O00453	97 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LEPROT	O15243	131 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV1-69	P01742	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV1-46	P01743	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	COX6C	P09669	75 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	COX7C	P15954	63 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	GLRX	P35754	106 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DLX1	P56177	255 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ESPL1	Q14674	2120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DAND5	Q8N907	189 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	RNF5	Q99942	180 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		2.76	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM223	A0PJW6	202 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGIP	A6NJ69	53 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809		H7C2G1	150 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	OVOL1	O14753	267 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NDUFB3	O43676	98 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	MGP	P08493	103 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	APELA	P0DMC3	54 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	MIA	Q16674	131 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ESM1	Q9NQ30	184 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	SEC16A	O15027	2179 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGF2R	P11717	2491 aa		2.75	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	OOSP1	A8MZH6	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809		M0R1B8	84 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TIMM17B	O60830	172 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LY6G6D	O95868	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CRYGD	P07320	174 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CNTFR	P26992	372 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	RHOH	Q15669	191 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	C5orf38	Q86SI9	138 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	C3orf56	Q8N813	242 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ZZEF1	O43149	2961 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809		A0A0J9YXY3	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM89	A2RUT3	159 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809		F5H768	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	NBR2	O15453	112 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	IGLV1-47	P01700	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	TRAC	P01848	142 aa		2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97

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