RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TGP01266 2768 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TSHBP01222 138 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 AMTP48728 403 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 ESRGQ1W209 222 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 FA2HQ7L5A8 372 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TMEM18Q96B42 140 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BKO60814 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BJP06899 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LINC00614P0C842 121 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BOP23527 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BBP33778 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BDP58876 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BCP62807 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LAGE3Q14657 143 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 BAGE3Q86Y29 109 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TMEM243Q9BU79 118 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 ESDP10768 282 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 K7EP13 123 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 UBE2L6O14933 153 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 NIT1Q86X76 327 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.96□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 NPSP0C0P6 89 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.94□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GUV1 79 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 SIVA1O15304 175 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 HSBP1O75506 76 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WX48 190 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TMEM262E9PQX1 116 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 SERF1AO75920 110 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 HBDP02042 147 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TOMM6Q96B49 74 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TMEM101Q96IK0 257 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 S100A6P06703 90 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 FGF6P10767 208 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 GAGE6Q13070 117 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 TTC32Q5I0X7 151 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 Q9H8V8 135 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.9□□□□□ -0.98
NISCH-208ENST00000481211 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 ERASQ7Z444 233 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 TMEM141Q96I45 108 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 TIMM17AQ99595 171 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 NDUFA6P56556 154 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 LINC00310P59036 64 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 RBX1P62877 108 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 A0A096LNJ9 63 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 ATP5LO75964 103 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 MPV17L2Q567V2 206 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 IGIPA6NJ69 53 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZN92 141 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NISCH-208ENST00000481211 CCL25O15444 150 aa8.85□□□□□ -0.99
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