RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479433.5

FBXO18-211, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 527 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-211ENST00000479433 Q6ZNX1 250 aa4.05□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.05□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 F2Z2F3 143 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 F5H697 171 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 J3QL48 77 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 PDE6DO43924 150 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 MGPP08493 103 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 CACNG7P62955 275 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 ODF1Q14990 250 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 C14orf177Q52M58 125 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 FAM104AQ969W3 186 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM243Q9BU79 118 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 TPPP3Q9BW30 176 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 NIT2Q9NQR4 276 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 MUC2Q02817 5179 aa4.04□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 TSHBP01222 138 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 IFNA1P01562 189 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 P01737 135 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 CRPP02741 224 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 ESDP10768 282 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 PKIAP61925 76 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 FOXI1Q12951 378 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 SLC51BQ86UW2 128 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RNF185Q96GF1 192 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 MED9Q9NWA0 146 aa4.03□□□□□ -1.76
FBXO18-211ENST00000479433 A0A087WYN8 130 aa4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.02□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 hDV102S1A0JD36 115 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 C9JQL5 133 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM250H0YL14 139 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 H7C1H1 209 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TRGC1P0CF51 173 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SMIM17P0DL12 118 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 AMTP48728 403 aa4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SDHAF1A6NFY7 115 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 FGF6P10767 208 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 COTL1Q14019 142 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TWIST1Q15672 202 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 HIGD2BQ4VC39 106 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 CT83Q5H943 113 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 ALKAL2Q6UX46 152 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 LINC01551Q86U37 167 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 NRACQ8N912 160 aa4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 A0A096LNI7 61 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 A0A1B0GVG6 124 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 PHOX2AO14813 284 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 NCR2O95944 276 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 COX6A2Q02221 97 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 V9GYV3 84 aa3.99□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 XKRY2A2RUG3 117 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SMKR1H3BMG3 65 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 H7C423 109 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 RAB4AP20338 218 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 KRTAP10-8P60410 259 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 Q6ZRU5 148 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 BIN3Q9NQY0 253 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.98□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 HIGD1CA8MV81 97 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TEX46H3BTG2 121 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 AMN1Q8IY45 258 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 NUP35Q8NFH5 326 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.97□□□□□ -1.77
FBXO18-211ENST00000479433 TSKUQ8WUA8 353 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms