RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 TIRAPP58753 221 aa11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 ESM1Q9NQ30 184 aa11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.37□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 AGRNO00468 2067 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0B4J2C4 111 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC01006Q8NI28 216 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 XCL2Q9UBD3 114 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 PCP4P48539 62 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 PROK1P58294 105 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 UBE2D3P61077 147 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 UBE2D2P62837 147 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 C16orf74Q96GX8 76 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.35□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 FBN2P35556 2912 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 TSPAN13O95857 204 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF183Q96D59 192 aa11.34□□□□□ -0.59
SUCLG2-202ENST00000460567 J3QKU1 62 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 TIMM17BO60830 172 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZSN1 163 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 H3BMG7 143 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 K7EQD1 137 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 SAP30O75446 220 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 APOMO95445 188 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IGLV1-51P01701 117 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 CFC1BP0CG36 223 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 CFC1P0CG37 223 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 HILS1P60008 231 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM104AQ969W3 186 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 SPANXCQ9NY87 97 aa11.33□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0J9YXY3 114 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PRX2 142 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 H7C423 109 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 HERVK_113P63121 156 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.32□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 COPS9Q8WXC6 57 aa11.31□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.31□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.31□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.3□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IFITM1P13164 125 aa11.3□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 PRO0461Q9UI25 63 aa11.3□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 M0QXV9 152 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 PLA2G2AP14555 144 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 CREBBPQ92793 2442 aa11.29□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 PRM2P04554 102 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 ERG28Q9UKR5 140 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 A4D1N5 150 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 WFDC2Q14508 124 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZUT4 128 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 NACAE9PAV3 2078 aa11.28□□□□□ -0.6
SUCLG2-202ENST00000460567 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.27□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.27□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFA1O15239 70 aa11.26□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PSMB2P49721 201 aa11.26□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 MIAQ16674 131 aa11.26□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRK2Q5S007 2527 aa11.26□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.25□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3-33P01772 117 aa11.25□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.25□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM101Q96IK0 257 aa11.25□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.25□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.24□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.24□□□□□ -0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZTI0 123 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 373.4 ms