RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GUV1 79 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PANO1I0J062 215 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 CEBPGP53567 150 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 CHTF8P0CG12 524 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 BCL2P10415 239 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 CFAP161Q6P656 301 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 OCC1Q8TAD7 63 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM12Q96EX1 92 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PMCHP20382 165 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 GATD1Q8NB37 220 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 GTSF1Q8WW33 167 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087WYN8 130 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 APCSP02743 223 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 COX6A2Q02221 97 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 MAJINQ3KP22 176 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC51BQ86UW2 128 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 BORCS7Q96B45 105 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM101Q96IK0 257 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 BTF3L4Q96K17 158 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1-204ENST00000459646 K7EN84 100 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SLPIP03973 132 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CTRLP40313 264 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZNX1 250 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf33Q8WU49 177 aa5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 A8MWL6 223 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 I3L3M4 83 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FGF6P10767 208 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 XCL1P47992 114 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX261Q6UWH6 196 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 C15orf56Q8N910 161 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF185Q96GF1 192 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 PHOX2AO14813 284 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 NCR2O95944 276 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 BLOC1S1P78537 153 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZRU5 148 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 STPG4Q8N801 248 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ST20Q9HBF5 79 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 H7C423 109 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CCL25O15444 150 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SS18Q15532 418 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FCER1GP30273 86 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 AKAP14Q86UN6 197 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 MRAP2Q96G30 205 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CNFNQ9BYD5 112 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.42□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GUT8 65 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF727A8MUV8 499 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM250H0YL14 139 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 GAS8-AS1O95177 125 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 MALP21145 153 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXI1Q12951 378 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A096LNI7 61 aa5.4□□□□□ -1.54
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