RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 K7ERJ3 54 aa9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 CRYBA4P53673 196 aa9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 LINC01006Q8NI28 216 aa9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
THBS3-202ENST00000428962 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.96□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.96□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 VCX2Q9H322 139 aa9.96□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 RS1O15537 224 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-53P01767 116 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 C12orf74Q32Q52 190 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 XCL2Q9UBD3 114 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 MTORP42345 2549 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 ACANP16112 2415 aa9.95□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SORL1Q92673 2214 aa9.94□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 A0A1B0GWB2 263 aa9.94□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 PROK1P58294 105 aa9.94□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SMR3AQ99954 134 aa9.94□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 PRM2P04554 102 aa9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 TMEM238C9JI98 176 aa9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 LEPROTO15243 131 aa9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 IL17DQ8TAD2 202 aa9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 TMEM223A0PJW6 202 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 IGLL5B9A064 214 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 J3QQQ9 107 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SAP30O75446 220 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 NDUFA7O95182 113 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 HILS1P60008 231 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 ZNF479Q96JC4 524 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 LY6G6DO95868 133 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 SVIPQ8NHG7 77 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 AMELXQ99217 191 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 A0A0J9YY99 117 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 Q6ZSN1 163 aa9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.9□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 AZU1P20160 251 aa9.9□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.9□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.9□□□□□ -0.82
THBS3-202ENST00000428962 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 A0A0J9YXV3 536 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 RRN3P1Q2M238 152 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 NACAE9PAV3 2078 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGLV1-51P01701 117 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.89□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.88□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.88□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.87□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 UBE2D1P51668 147 aa9.87□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 C16orf74Q96GX8 76 aa9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.86□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 K7EQD1 137 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-30P01768 117 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 FAM104AQ969W3 186 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 Q9UF83 564 aa9.85□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 SCGB1A1P11684 91 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 G3V4G9 280 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 Q6ZUT4 128 aa9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
THBS3-202ENST00000428962 NF1P21359 2839 aa9.83□□□□□ -0.84
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.83□□□□□ -0.84
THBS3-202ENST00000428962 INAFM1C9JVW0 142 aa9.83□□□□□ -0.84
THBS3-202ENST00000428962 F8W1H4 67 aa9.83□□□□□ -0.84
THBS3-202ENST00000428962 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.83□□□□□ -0.84
THBS3-202ENST00000428962 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.83□□□□□ -0.84
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