RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 MED28Q9H204 178 aa8.82□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.81□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.8□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 CFAP161Q6P656 301 aa8.8□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.8□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 H7C1H1 209 aa8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 MGPP08493 103 aa8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 RASL11AQ6T310 242 aa8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 REG3GQ6UW15 175 aa8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 TMUB2Q71RG4 321 aa8.79□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 SULT1A2P50226 295 aa8.78□□□□□ -1
NFE4-201ENST00000420058 NIT2Q9NQR4 276 aa8.78□□□□□ -1
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NFE4-201ENST00000420058 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.77□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.76□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.76□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.76□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GV50 99 aa8.75□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 Q6ZRP5 223 aa8.75□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.75□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 UBE2L6O14933 153 aa8.74□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.74□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 NTF3P20783 257 aa8.73□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 CCL20P78556 96 aa8.73□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 Q6ZNX1 250 aa8.73□□□□□ -1.01
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NFE4-201ENST00000420058 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.73□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 ARPC5O15511 151 aa8.72□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.72□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 C11orf52Q96A22 123 aa8.72□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.72□□□□□ -1.01
NFE4-201ENST00000420058 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 A0A1W2PNN7 141 aa8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 F2Z2F3 143 aa8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 PFDN1O60925 122 aa8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.71□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.7□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 RAB19A4D1S5 217 aa8.7□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 FAM231BA6NCW3 169 aa8.7□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 TRGC1P0CF51 173 aa8.7□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 FGF6P10767 208 aa8.7□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 CENPWQ5EE01 88 aa8.7□□□□□ -1.02
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NFE4-201ENST00000420058 XCL1P47992 114 aa8.69□□□□□ -1.02
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NFE4-201ENST00000420058 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 SMLR1H3BR10 107 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 H7C423 109 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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NFE4-201ENST00000420058 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 CARD19Q96LW7 228 aa8.68□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 CCL25O15444 150 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 NCR2O95944 276 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 IFNA1P01562 189 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 CTRLP40313 264 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 SYCNQ0VAF6 134 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.67□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.66□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 NUDT11Q96G61 164 aa8.66□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 ESDP10768 282 aa8.65□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 TWIST1Q15672 202 aa8.65□□□□□ -1.02
NFE4-201ENST00000420058 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.65□□□□□ -1.02
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NFE4-201ENST00000420058 XKRY2A2RUG3 117 aa8.64□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.64□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 APCSP02743 223 aa8.64□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 GAGE2BQ13066 116 aa8.64□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 SMIM12Q96EX1 92 aa8.64□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 GNG4P50150 75 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 ZNF345Q14585 488 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 MANBALQ9NQG1 85 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.63□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.62□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.62□□□□□ -1.03
NFE4-201ENST00000420058 BCL2P10415 239 aa8.62□□□□□ -1.03
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