RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R1W7 72 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPS13CQ709C8 3753 aa8.06□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 KNCNA6PVL3 124 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRAC2D3DTV9 90 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSHBP01222 138 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF580Q9UK33 172 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.04□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.03□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.03□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8NA96 180 aa8.03□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 GHRHP01286 108 aa8.03□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.03□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NXPH4O95158 308 aa8.02□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 HILS1P60008 231 aa8.02□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.02□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.02□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.02□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 F8W735 103 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 XCL1P47992 114 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 XCL2Q9UBD3 114 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.02□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0J9YXY3 114 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM17BO60830 172 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHG2P01859 326 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 ECSCRQ19T08 205 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 H7BZZ5 65 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 BUB3O43684 328 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB1P60022 68 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DAND5Q8N907 189 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 WFDC9Q8NEX5 89 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPM3Q9P2X0 92 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 LEPROTO15243 131 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAL4O96015 105 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00846Q9NV44 126 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CUBNO60494 3623 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTSGP08311 255 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGPP08493 103 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 C22orf24Q9Y442 160 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGIPA6NJ69 53 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 G3V318 75 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R381 172 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCKP06307 115 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6JHZ5 121 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGF1P05019 195 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 LITAFQ99732 161 aa7.97□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF876PQ49A33 203 aa7.96□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.96□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNURFQ9Y675 71 aa7.96□□□□□ -1.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 C15orf32Q32M92 178 aa7.96□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.96□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.96□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q9HAA7 133 aa7.96□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 U3KQE9 123 aa7.96□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.95□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.95□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF223E7ERA6 249 aa7.95□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD164Q04900 197 aa7.95□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.95□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.94□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV12-3P01733 135 aa7.94□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms