RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ERASQ7Z444 233 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 P0DMU3 169 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM231AP0DMU4 169 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM231CP0DMU5 169 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB130BP0DP73 79 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB130AP0DP74 79 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EQD1 137 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 RIPPLY3P57055 190 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM141Q96I45 108 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 COL6A5A8TX70 2615 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 G3V4G9 280 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 COTL1Q14019 142 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TSHBP01222 138 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ATOH7Q8N100 152 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO1933Q9H354 126 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMAT4Q9H898 229 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DAD1P61803 113 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 FHL2Q14192 279 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA45Q537H7 98 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM17AQ99595 171 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DKK2Q9UBU2 259 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 STAB1Q9NY15 2570 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WX48 190 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 IGIPA6NJ69 53 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ODF1Q14990 250 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 Q9UF83 564 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE12JA6NER3 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 DPM2O94777 84 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NPSP0C0P6 89 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE1Q13065 139 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE4Q13068 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE5Q13069 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE13Q4V321 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8NAQ8 132 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO0255Q9UI72 69 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB4AO15263 64 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKCP01834 107 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PLNP26678 52 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DDTP30046 118 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2D3P61077 147 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2D2P62837 147 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PMVKQ15126 192 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 BAALCQ8WXS3 180 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 VCX2Q9H322 139 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 VWFP04275 2813 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 F8VRH5 84 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5G1P05496 136 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBA4P53673 196 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 MAJINQ3KP22 176 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 CST9LQ9H4G1 147 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 hDV102S1A0JD36 115 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLC3P0DOY3 106 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C423 109 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms