RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZQT7 251 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 RASL10AQ92737 203 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 PRR25Q96S07 402 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.56□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 SOCS3O14543 225 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 MDFICQ9P1T7 246 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A20O43772 301 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 ZNF815PA8K554 130 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 K7EQG2 157 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 NRACQ8N912 160 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 DCANP1Q8TF63 244 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 ODF3Q96PU9 254 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 RBAKDNA6NC62 111 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS3-201ENST00000318129 CFC1P0CG37 223 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS3-201ENST00000318129 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS3-201ENST00000318129 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 Q8N1Y9 231 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 RNF182Q8N6D2 247 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 TMEM126AQ9H061 195 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 C9JAW5 83 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 HLA-DMBP28068 263 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-201ENST00000318129 IGLV1-51P01701 117 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 ORM1P02763 201 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 C20orf173Q96LM9 149 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 Q8TAT8 98 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 LINC01600Q96MT4 127 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 SORL1Q92673 2214 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 A0A0J9YY99 117 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 LINC01587Q99440 93 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-30P01768 117 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 LINC00477Q96M19 166 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 PRAC2D3DTV9 90 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 TOMM6Q96B49 74 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 ERCC8Q13216 396 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 BAALCQ8WXS3 180 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 P0DMU3 169 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 FAM231AP0DMU4 169 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 FAM231CP0DMU5 169 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.48□□□□□ -1.21
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GINS3-201ENST00000318129 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.48□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-33P01772 117 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 DEFB131AP59861 70 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 C5orf47Q569G3 176 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 A0A0J9YX75 114 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 LINC01620Q4KN68 170 aa7.47□□□□□ -1.21
GINS3-201ENST00000318129 WIPF1O43516 503 aa7.46□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 F6UB75 175 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 M0R2P5 195 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 CRYGDP07320 174 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 LINC00694P0DN24 101 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 ATXN8Q156A1 80 aa7.45□□□□□ -1.22
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