RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 GAGE5Q13069 117 aa13.56□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 GAGE13Q4V321 117 aa13.56□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FBN3Q75N90 2809 aa13.56□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 STAB2Q8WWQ8 2551 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 VCYO14598 125 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00614P0C842 121 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FA2HQ7L5A8 372 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.55□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 GYPEP15421 78 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 Q8N8P6 123 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 HSBP1O75506 76 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 KIR2DL4Q99706 377 aa13.54□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.53□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.53□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 I3L3M4 83 aa13.52□□□□□ -0.24
SYTL1-201ENST00000318074 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 UBE2D3P61077 147 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 UBE2D2P62837 147 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 TCAPO15273 167 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.51□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.5□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 FCER1GP30273 86 aa13.5□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA45Q537H7 98 aa13.5□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 H3BNG1 76 aa13.49□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 K7EMI3 77 aa13.49□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 PMCHL1Q16048 86 aa13.49□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.49□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 LAGE3Q14657 143 aa13.48□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.48□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00694P0DN24 101 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 COTL1Q14019 142 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 LINC01546A6NGU7 62 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 IGLC3P0DOY3 106 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.47□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 A0A096LPF7 62 aa13.46□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 TSHBP01222 138 aa13.46□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.46□□□□□ -0.25
SYTL1-201ENST00000318074 C20orf202A1L168 122 aa13.45□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 NUDT3O95989 172 aa13.45□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.43□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.43□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.43□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 IGLL5B9A064 214 aa13.42□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 G0S2P27469 103 aa13.42□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.42□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 ATOH7Q8N100 152 aa13.41□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.41□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 HBDP02042 147 aa13.41□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.41□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.4□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.4□□□□□ -0.26
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 MAJINQ3KP22 176 aa13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 Q6ZN92 141 aa13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 LEPROTL1O95214 131 aa13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.39□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 A0A096LNJ9 63 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.38□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 NUPR2A6NF83 97 aa13.37□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM243Q9BU79 118 aa13.37□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 BATFQ16520 125 aa13.36□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.36□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.36□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 TOMM6Q96B49 74 aa13.36□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 LINC01549A6NIU2 74 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 TGP01266 2768 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 UBE2L6O14933 153 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 PET117Q6UWS5 81 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.35□□□□□ -0.27
SYTL1-201ENST00000318074 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.33□□□□□ -0.28
SYTL1-201ENST00000318074 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.33□□□□□ -0.28
SYTL1-201ENST00000318074 TIRAPP58753 221 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms