RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 COX11Q9Y6N1 276 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 STAB1Q9NY15 2570 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 PMVKQ15126 192 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 BOD1L2Q8IYS8 172 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 NMUP48645 174 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf54Q6X4T0 127 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE12BA1L429 117 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 K7EQD1 137 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE7O76087 117 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE12FP0CL80 117 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE12GP0CL81 117 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE12IP0CL82 117 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 CBY1Q9Y3M2 126 aa19.16■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV2A0A075B6R0 118 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 CIDEAO60543 219 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 CST9LQ9H4G1 147 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXD8-201ENST00000313173 COL6A5A8TX70 2615 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf91Q6ZV80 131 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 SHISA2Q6UWI4 295 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 PCP2Q8IVA1 136 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM9A6NGZ8 99 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 PTTG1IPP53801 180 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 CHCHD7Q9BUK0 85 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 X6R8D5 127 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 APOC4P55056 127 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2V1Q13404 147 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 COTL1Q14019 142 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 ZNRF2Q8NHG8 242 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A29Q8N8R3 303 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 EMP1P54849 157 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa19.08■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 SIVA1O15304 175 aa19.08■□□□□ 0.65
HOXD8-201ENST00000313173 CCL25O15444 150 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00612Q8N6U2 182 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa19.06■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf86A6NJI1 115 aa19.06■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 MPV17L2Q567V2 206 aa19.06■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2D3P61077 147 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2D2P62837 147 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXA1Q9NS26 97 aa19.05■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM97Q5BJF2 176 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 CRYBA4P53673 196 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB135Q30KP9 77 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 TTTY13Q9BZ97 58 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 VCX2Q9H322 139 aa19.04■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE12JA6NER3 117 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE4Q13068 117 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE5Q13069 117 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 GAGE13Q4V321 117 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 FAM104AQ969W3 186 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa19.03■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 FHL2Q14192 279 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXD8-201ENST00000313173 E9PLD3 99 aa19.02■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 NFE4Q86UQ8 179 aa19.02■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 AMELXQ99217 191 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 K7EP13 123 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 OR11H2Q8NH07 326 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB130BP0DP73 79 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB130AP0DP74 79 aa19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZVH6 145 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 HIGD1BQ9P298 99 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 HERVK_113P61574 105 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 CHAC1Q9BUX1 264 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 OXLD1Q5BKU9 147 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 PRADC1Q9BSG0 188 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM21Q9BVV7 248 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 TAX1BP3O14907 124 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 LYRM9A8MSI8 78 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 HSD52Q0P140 79 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 VAMP3Q15836 100 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM170BQ5T4T1 132 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXD8-201ENST00000313173 FAM222AQ5U5X8 452 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXD8-201ENST00000313173 GTSF1LQ9H1H1 148 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms