RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 NDUFA4O00483 81 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGHV1-69P01742 117 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 Q6ZSN1 163 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 RS1O15537 224 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.58□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 APCP25054 2843 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 RHODO00212 210 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TEX29Q8N6K0 151 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 DCANP1Q8TF63 244 aa9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 A0A0J9YXY3 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.56□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGHV3-53P01767 116 aa9.56□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.56□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TMEM223A0PJW6 202 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 FAM223BA6NKX1 122 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 SCGB1A1P11684 91 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 CFHR3Q02985 330 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 KLLNB2CW77 178 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.55□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 SNCGO76070 127 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 LINC01620Q4KN68 170 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 J3QKU1 62 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 ATP5J2P56134 94 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 C2orf82Q6UX34 121 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.54□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 GAGE2BQ13066 116 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 GAGE2EQ4V326 116 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.53□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 DEFB131AP59861 70 aa9.52□□□□□ -0.88
SNX1-201ENST00000261889 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 TIMM17AQ99595 171 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.52□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ITPR3Q14573 2671 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 A0A087WW49 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 SLURP1P55000 103 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 IGHG2P01859 326 aa9.51□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LEPROTO15243 131 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ID1P41134 155 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 TMEM141Q96I45 108 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 A0A0J9YX75 114 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 FAM104AQ969W3 186 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 I3L3M4 83 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LINC01619G3V211 115 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LGALS9O00182 355 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ODF3Q96PU9 254 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 H7C423 109 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 PPP1R17O96001 155 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 COX6A2Q02221 97 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 CCL19Q99731 98 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 XCL2Q9UBD3 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 ATXN8Q156A1 80 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 C9orf85Q96MD7 179 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PRX2 142 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 H3BMM0 161 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 M0R2P5 195 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 Q8N2B8 174 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 UBE2WQ96B02 151 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 A6NDX4 124 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 NXPH4O95158 308 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 LITAFQ99732 161 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 USMG5Q96IX5 58 aa9.46□□□□□ -0.89
SNX1-201ENST00000261889 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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