RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.07□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.07□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 RETNQ9HD89 108 aa10.07□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 AVPP01185 164 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2V1Q13404 147 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 POLEQ07864 2286 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 A4D1N5 150 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 NBASA2RRP1 2371 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A096LNI7 61 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 K7EP34 96 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 ACYP1P07311 99 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 EML6Q6ZMW3 1958 aa10.06□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1W2PPM0 123 aa10.05□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 TDRG1Q3Y452 100 aa10.05□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZS46 218 aa10.05□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PDE6GP18545 87 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 DOCK10Q96BY6 2186 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV4-1P06312 121 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.04□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 E9PLD3 99 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 CASC2Q6XLA1 102 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PYY3Q5JQD4 70 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 P0C879 139 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.03□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.02□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PCP2Q8IVA1 136 aa10.02□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 UPK3BQ9BT76 320 aa10.02□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.02□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2D2P62837 147 aa10.02□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.02□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV1-51P01701 117 aa10.01□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 PCP4P48539 62 aa10.01□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 ABCA1O95477 2261 aa10.01□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 ROS1P08922 2347 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 WFDC9Q8NEX5 89 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 RBX1P62877 108 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 SS18L2Q9UHA2 77 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 BRI3O95415 125 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 SPANXCQ9NY87 97 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 HIVEP2P31629 2446 aa10□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.99□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.99□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 CREBBPQ92793 2442 aa9.99□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A0B4J2C4 111 aa9.98□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.98□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 H3BMG7 143 aa9.98□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 DLEU1O43261 78 aa9.98□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 M0R378 163 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 M0QY20 66 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLC6P0CF74 106 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 ALPK3Q96L96 1907 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.97□□□□□ -0.81
PDGFRB-201ENST00000261799 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.96□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.96□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 PROK1P58294 105 aa9.96□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.96□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 C10orf142B7Z368 130 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CADP27708 2225 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 TCL1BO95988 128 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV2D-28P01615 120 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 DCANP1Q8TF63 244 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.95□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 G3V4G9 280 aa9.94□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM258P61165 79 aa9.94□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.94□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 ETDBQ3ZM63 59 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZTC4 211 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 DSCAMO60469 2012 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.93□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CLEC2BQ92478 149 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms