RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZSN1 163 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 PRO0461Q9UI25 63 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 RHODO00212 210 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A20O43772 301 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 PSMB8P28062 276 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GV72 72 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 ELANEP08246 267 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 K7EQG2 157 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA7O95182 113 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2D1P51668 147 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TIMM17AQ99595 171 aa9.87□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 XGP55808 180 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 CLEC2BQ92478 149 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 ATP6V0BQ99437 205 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 CARD19Q96LW7 228 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 H3BUA1 57 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS9O00182 355 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM223A0PJW6 202 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0J9YXY3 114 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 K7EMT4 169 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 LEPROTO15243 131 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 MED14OSP0DP75 135 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 FHL3Q13643 280 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZUT4 128 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 TEN1Q86WV5 123 aa9.84□□□□□ -0.83
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf85Q96MD7 179 aa9.83□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-9P60411 292 aa9.83□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.83□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.82□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.82□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 USP24Q9UPU5 2620 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 GAGE12JA6NER3 117 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 M0R2P5 195 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-33P01772 117 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 GAGE4Q13068 117 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 GAGE5Q13069 117 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf82Q6UX34 121 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 CDIP1Q9H305 208 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RHOHQ15669 191 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 PRORYQ9H606 182 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 TRIAP1O43715 76 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2D3P61077 147 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2D2P62837 147 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 H3BMM0 161 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G2AP14555 144 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA25Q9BR10 227 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 SNCGO76070 127 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 COX6CP09669 75 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 STHQ8IWL8 128 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 NXPH4O95158 308 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 TEX29Q8N6K0 151 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF415Q09FC8 603 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 ATXN8Q156A1 80 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01620Q4KN68 170 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 TTC32Q5I0X7 151 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 RNF183Q96D59 192 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 AMELXQ99217 191 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 Q9H8V8 135 aa9.77□□□□□ -0.84
TMOD1-201ENST00000259365 KLK9Q2XQG4 91 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 C3orf56Q8N813 242 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms