RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 NRACQ8N912 160 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 SPAG11BQ08648 103 aa12.11□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.1□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 A0A0J9YX75 114 aa12.09□□□□□ -0.47
CTIF-201ENST00000256413 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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CTIF-201ENST00000256413 FREM1Q5H8C1 2179 aa12.09□□□□□ -0.47
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CTIF-201ENST00000256413 UBE2D2P62837 147 aa12.08□□□□□ -0.48
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CTIF-201ENST00000256413 MED13LQ71F56 2210 aa12.07□□□□□ -0.48
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CTIF-201ENST00000256413 M0QY20 66 aa12.05□□□□□ -0.48
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CTIF-201ENST00000256413 CDIP1Q9H305 208 aa12.05□□□□□ -0.48
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CTIF-201ENST00000256413 A6NED7 52 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-201ENST00000256413 A8MZ25 164 aa12.04□□□□□ -0.48
CTIF-201ENST00000256413 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.04□□□□□ -0.48
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CTIF-201ENST00000256413 PLXNB1O43157 2135 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-201ENST00000256413 C6orf99Q4VX62 202 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WVE0 104 aa12□□□□□ -0.49
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CTIF-201ENST00000256413 TNCP24821 2201 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-201ENST00000256413 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-201ENST00000256413 CNFNQ9BYD5 112 aa11.98□□□□□ -0.49
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CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.98□□□□□ -0.49
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CTIF-201ENST00000256413 RETNQ9HD89 108 aa11.96□□□□□ -0.49
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CTIF-201ENST00000256413 ESM1Q9NQ30 184 aa11.96□□□□□ -0.5
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CTIF-201ENST00000256413 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 NOTCH4Q99466 2003 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 A0A096LNJ9 63 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 IGIPA6NJ69 53 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.93□□□□□ -0.5
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