RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHV3-33P01772 117 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 PPBPP02775 128 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 ORMDL3Q8N138 153 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 IQCJQ1A5X6 159 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 NRACQ8N912 160 aa14.69□□□□□ -0.06
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SLC25A39-201ENST00000225308 PRELID3AQ96N28 172 aa14.67□□□□□ -0.06
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SLC25A39-201ENST00000225308 COTL1Q14019 142 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.66□□□□□ -0.06
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SLC25A39-201ENST00000225308 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A087WX48 190 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 PHOX2AO14813 284 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 TNFRSF6BO95407 300 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 NPYP01303 97 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 MPV17L2Q567V2 206 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.64□□□□□ -0.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 LAGE3Q14657 143 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM262E9PQX1 116 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 I3L3M4 83 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 AMTP48728 403 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM243Q9BU79 118 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 PMCHP20382 165 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 GAGE6Q13070 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 Q8N976 141 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 C20orf78Q9BR46 151 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 PKD1P98161 4303 aa14.61□□□□□ -0.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 PKIAP61925 76 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 TNP2Q05952 138 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 KLK12Q9UKR0 248 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 NFE4Q86UQ8 179 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC25A39-201ENST00000225308 Q9HAA7 133 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf196B1AJZ1 125 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GVY2 172 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 VCYO14598 125 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SLC25A39-201ENST00000225308 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GUV1 79 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2L6O14933 153 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BKO60814 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BJP06899 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 ESDP10768 282 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BOP23527 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BBP33778 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BDP58876 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BCP62807 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2WQ96B02 151 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 KIR2DL4Q99706 377 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 FCER1GP30273 86 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 Q0VG73 95 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 ENHOQ6UWT2 76 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 Q8N8P6 123 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 PRR34Q9NV39 138 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC25A39-201ENST00000225308 H7C423 109 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB5BP61020 215 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 FGF6P10767 208 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 BAGE3Q86Y29 109 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC25A39-201ENST00000225308 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.5□□□□□ -0.09
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