RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 UBE2D3P61077 147 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 HERVK_113P61574 105 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 UBE2D2P62837 147 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 FBN2P35556 2912 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 C9JAW5 83 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 CR1P17927 2039 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4-201ENST00000221770 ZNF815PA8K554 130 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 SFTA2Q6UW10 78 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 TMEM101Q96IK0 257 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 I3L3M4 83 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 HTN1P15515 57 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 EMP1P54849 157 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 DUX3Q96PT4 197 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 J3KT08 172 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 TMEM86BQ8N661 226 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.51□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.5□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 TCL1BO95988 128 aa11.5□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.5□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.5□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 P0DMU3 169 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 FAM231AP0DMU4 169 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 FAM231CP0DMU5 169 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.49□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 F5H768 121 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 M0R2P5 195 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.48□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 A0A1B0GX51 115 aa11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 ZNF415Q09FC8 603 aa11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.47□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.46□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 NDUFA7O95182 113 aa11.46□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 Q6ZSV7 163 aa11.46□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
POP4-201ENST00000221770 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.46□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 POLQO75417 2590 aa11.45□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 HERVK_113P63121 156 aa11.45□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.45□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 USP24Q9UPU5 2620 aa11.45□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 PRM2P04554 102 aa11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 UBE2D1P51668 147 aa11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 A0A0J9YY99 117 aa11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 PROK1P58294 105 aa11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 ZANQ9Y493 2812 aa11.43□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.43□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 SLC25A20O43772 301 aa11.43□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 J3QQQ9 107 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 SORL1Q92673 2214 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 TMEM223A0PJW6 202 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 INSP01308 110 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 F8WDY8 70 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 LEPROTO15243 131 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 CD28P10747 220 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.41□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.4□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.4□□□□□ -0.58
POP4-201ENST00000221770 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
POP4-201ENST00000221770 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms