RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 FAM231CP0DMU5 169 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GYPEP15421 78 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RAB4AP20338 218 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RASL11AQ6T310 242 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GATD1Q8NB37 220 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RNF185Q96GF1 192 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 FAM210BQ96KR6 192 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 YPEL4Q96NS1 127 aa5.95□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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SGMS1-211ENST00000626236 GAGE12JA6NER3 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 SMKR1H3BMG3 65 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 H3BNG1 76 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 M0QY20 66 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 NCR2O95944 276 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE1Q13065 139 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE4Q13068 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE5Q13069 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 COX19Q49B96 90 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE13Q4V321 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 MRAP2Q96G30 205 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 Q9UF83 564 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.94□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 A0A096LPF7 62 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf84H3BNL1 204 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 GAS8-AS1O95177 125 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DQA1P01909 254 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 APCSP02743 223 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 SRIP30626 198 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 CKS2P33552 79 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 CASC10Q5T4H9 136 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 D6R8Y8 96 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 MT-ND6P03923 174 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 FRZBQ92765 325 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 NIT2Q9NQR4 276 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 APLNQ9ULZ1 77 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 LYSTQ99698 3801 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TENM2Q9NT68 2774 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 COLCA2A8K830 154 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00694P0DN24 101 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TCTAP57738 103 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2D3P61077 147 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-211ENST00000626236 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 ORMDL3Q8N138 153 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.9□□□□□ -1.46
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SGMS1-211ENST00000626236 PPBPP02775 128 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 NRACQ8N912 160 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 PRELID3AQ96N28 172 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 ST20Q9HBF5 79 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF6BO95407 300 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 NPYP01303 97 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 RAB5AP20339 215 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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SGMS1-211ENST00000626236 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 H3BS24 57 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 ESRGQ1W209 222 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.88□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 I3L3M4 83 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 PHOX2AO14813 284 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 TRGC2P03986 189 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 PMCHP20382 165 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 CCL18P55774 89 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf78Q9BR46 151 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-211ENST00000626236 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.87□□□□□ -1.47
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