RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEBPG	P53567	150 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAB4B	P61018	213 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RHEB	Q15382	184 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	FRZB	Q92765	325 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	GHRH	P01286	108 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	PKIA	P61925	76 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDE6D	O43924	150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	GNG4	P50150	75 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	SST	P61278	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q8N814	137 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPPP3	Q9BW30	176 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRP	P02741	224 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	NIT1	Q86X76	327 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	C11orf52	Q96A22	123 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		H7C1H1	209 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNAI2	O43623	268 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2D3	P61077	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2D2	P62837	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q0VG73	95 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		P01737	135 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MGP	P08493	103 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNG7	P62955	275 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q8N976	141 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q9UF83	564 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		F2Z2F3	143 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q8N3U1	123 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	LECT2	O14960	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADIRF	Q15847	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	XG	P55808	180 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q5VSD8	79 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	RYR1	P21817	5038 aa		7.27	□□□□□ -1.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSPG2	P98160	4391 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	GZMB	P10144	247 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms