RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 HTN3P15516 51 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZTC4 211 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZTI0 123 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 AP1S3Q96PC3 154 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 CELA1Q9UNI1 258 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.51□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 H3BNG1 76 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 SNAI2O43623 268 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 PRM2P04554 102 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 S100A2P29034 98 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA6P56556 154 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZQT7 251 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 PRO0255Q9UI72 69 aa5.5□□□□□ -1.53
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ZNF548-208ENST00000597576 RS1O15537 224 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 IGLC6P0CF74 106 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 CTRLP40313 264 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 RIGQ13278 110 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 APLNQ9ULZ1 77 aa5.49□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GXF2 115 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 HIGD1CA8MV81 97 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 IGLL5B9A064 214 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 H7C1H1 209 aa5.48□□□□□ -1.53
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ZNF548-208ENST00000597576 NXPH4O95158 308 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 TWIST1Q15672 202 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 CNFNQ9BYD5 112 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 NIT2Q9NQR4 276 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.48□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 NACAE9PAV3 2078 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GUT8 65 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-53P01767 116 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 GZMBP10144 247 aa5.47□□□□□ -1.53
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ZNF548-208ENST00000597576 Q0VG73 95 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 RHOHQ15669 191 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 NUP35Q8NFH5 326 aa5.47□□□□□ -1.53
ZNF548-208ENST00000597576 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.47□□□□□ -1.53
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ZNF548-208ENST00000597576 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 C16orf90A8MZG2 172 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 F5H697 171 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 P0DMU3 169 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 FAM231AP0DMU4 169 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 FAM231CP0DMU5 169 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 ESDP10768 282 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 NTF3P20783 257 aa5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.46□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 K7EQD1 137 aa5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 NUDT3O95989 172 aa5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R17O96001 155 aa5.45□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 MGPP08493 103 aa5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 SRIP30626 198 aa5.45□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 CCL18P55774 89 aa5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 FHL2Q14192 279 aa5.45□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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ZNF548-208ENST00000597576 LRP2P98164 4655 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 A0A087WWL8 130 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 EPM2AB3EWF7 344 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 FABP4P15090 132 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 SSTP61278 116 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZR54 194 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.44□□□□□ -1.54
ZNF548-208ENST00000597576 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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