RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 ACANP16112 2415 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV1-44P01699 117 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 RHOHQ15669 191 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 C8orf49Q96NF6 230 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 CNFNQ9BYD5 112 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM223A0PJW6 202 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-46P01743 117 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 UPK3BQ9BT76 320 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC8Q13216 396 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZS46 218 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf86A6NJI1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFB3O43676 98 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHG2P01859 326 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM178BH3BS89 294 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 CCL3L1P16619 93 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 BSPH1Q075Z2 132 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 JMJD1CQ15652 2540 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-218ENST00000590367 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-48P01763 117 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 USP17L23D6RBM5 183 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 APELAP0DMC3 54 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R17O96001 155 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE6HQ13956 83 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6JHZ5 121 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TNCP24821 2201 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 UBE2E1P51965 193 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF182Q8N6D2 247 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LEPROTO15243 131 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAL4O96015 105 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 BSNQ9UPA5 3926 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 PRSS2P07478 247 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 NRACQ8N912 160 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 DCANP1Q8TF63 244 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 CLEC2BQ92478 149 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LRBAP50851 2863 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 GAS8-AS1O95177 125 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 PMAIP1Q13794 54 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM141Q96I45 108 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV1-16P04430 117 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 GAFA1Q96PS6 74 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 COX7A1P24310 79 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 RETNQ9HD89 108 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0J9YX75 114 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRY2O43597 315 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 LYNX1P0DP58 116 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-218ENST00000590367 WT1-ASQ06250 92 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.5 ms