RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N976 141 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 BTF3P20290 206 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZSN1 163 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 COL6A5A8TX70 2615 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 SCGB1D1O95968 90 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 G3V4G9 280 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 TCAPO15273 167 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF183Q96D59 192 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 C18orf15Q96N68 181 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-207ENST00000589146 MDFIQ99750 246 aa16.27■□□□□ 0.2
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CAPNS1-207ENST00000589146 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF479Q96JC4 524 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 PET117Q6UWS5 81 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 OR11H2Q8NH07 326 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE12BA1L429 117 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE7O76087 117 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE12FP0CL80 117 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE12GP0CL81 117 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE12IP0CL82 117 aa16.23■□□□□ 0.19
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CAPNS1-207ENST00000589146 KIR2DL4Q99706 377 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDT3O95989 172 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 G0S2P27469 103 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01549A6NIU2 74 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 LYRM9A8MSI8 78 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 I3L3M4 83 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 P0DMU3 169 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM231AP0DMU4 169 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM231CP0DMU5 169 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TOMM6Q96B49 74 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.21■□□□□ 0.19
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CAPNS1-207ENST00000589146 Q8NAQ8 132 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5LO75964 103 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 EMP1P54849 157 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 K7EQD1 137 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 TSHBP01222 138 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A12P80511 92 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01545Q5VT33 79 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 C20orf202A1L168 122 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 Q9UF83 564 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 FHL2Q14192 279 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 DKK2Q9UBU2 259 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 ERASQ7Z444 233 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 SCGB3A1Q96QR1 104 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB130BP0DP73 79 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB130AP0DP74 79 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMAT4Q9H898 229 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2D3P61077 147 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2D2P62837 147 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 IGIPA6NJ69 53 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM141Q96I45 108 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 VAMP8Q9BV40 100 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-207ENST00000589146 FBN3Q75N90 2809 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 SPART-AS1P0CW21 52 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 PKIAP61925 76 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM17AQ99595 171 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.07■□□□□ 0.16
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