RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 Q9UF83 564 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RYR3Q15413 4870 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 IGLL5B9A064 214 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 APCSP02743 223 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 P0DMU3 169 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 FAM231AP0DMU4 169 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 FAM231CP0DMU5 169 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 CKS2P33552 79 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ORMDL3Q8N138 153 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 NRACQ8N912 160 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TENM2Q9NT68 2774 aa8.01□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 A0A096LPF7 62 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 D6R8Y8 96 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 PHOX2AO14813 284 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAS8-AS1O95177 125 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RAB5AP20339 215 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 UBE2D3P61077 147 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 UBE2D2P62837 147 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 APLNQ9ULZ1 77 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 SMKR1H3BMG3 65 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 NCR2O95944 276 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 C20orf78Q9BR46 151 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.99□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAGE12JA6NER3 117 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 PRSS47A8MTI9 375 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TNFRSF6BO95407 300 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 SRIP30626 198 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TIRAPP58753 221 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAGE1Q13065 139 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAGE4Q13068 117 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAGE5Q13069 117 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GAGE13Q4V321 117 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 CASC10Q5T4H9 136 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 PRELID3AQ96N28 172 aa7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 NUDT3O95989 172 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 ST20Q9HBF5 79 aa7.97□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 NPYP01303 97 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.96□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 TRGC2P03986 189 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LYSTQ99698 3801 aa7.95□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 I3L3M4 83 aa7.94□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 VCYO14598 125 aa7.94□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 ESRGQ1W209 222 aa7.94□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.94□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.94□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.93□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 K7EMI3 77 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 TCAPO15273 167 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 PMCHP20382 165 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 CCL18P55774 89 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 COTL1Q14019 142 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LELP1Q5T871 98 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 Q8N8P6 123 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 TSHBP01222 138 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 IQCJQ1A5X6 159 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 KIR2DL4Q99706 377 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 UPK3BQ9BT76 320 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.91□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LINC01546A6NGU7 62 aa7.9□□□□□ -1.14
GGA3-211ENST00000582232 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms