RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM159AQ6UWV7 190 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM61Q8N0U2 210 aa17.81■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRADC1Q9BSG0 188 aa17.81■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRYGDP07320 174 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPINK13Q1W4C9 94 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DYNLRB2Q8TF09 96 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAX2Q96IS3 184 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ODF3Q96PU9 254 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL32P62910 135 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCGB2A2Q13296 93 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRN3P1Q2M238 152 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSHBP01222 138 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL24P83731 157 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01006Q8NI28 216 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYSLTR1Q9Y271 337 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB131AP59861 70 aa17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOTCH2Q04721 2471 aa17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KNCNA6PVL3 124 aa17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JPT2Q9H910 190 aa17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F8W1H4 67 aa17.77■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD7P09564 240 aa17.77■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WFDC2Q14508 124 aa17.77■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa17.76■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGIPA6NJ69 53 aa17.76■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BMG7 143 aa17.76■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUMO4Q6EEV6 95 aa17.76■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIVEP2P31629 2446 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF815PA8K554 130 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HILS1P60008 231 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP2Q6ZN57 461 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHB2Q96CS7 222 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C16orf95Q9H693 158 aa17.75■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCL24O00175 119 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB114Q30KQ6 69 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMTNQ6UX39 209 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNK1Q9H4A3 2382 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf86A6NJI1 115 aa17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRO0461Q9UI25 63 aa17.73■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FHL3Q13643 280 aa17.72■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WWL8 130 aa17.72■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV2A0A0B4J234 112 aa17.71■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LY6G6DO95868 133 aa17.71■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa17.71■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL39P62891 51 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VCYO14598 125 aa17.7■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01549A6NIU2 74 aa17.7■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PMVKQ15126 192 aa17.7■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8N1Y9 231 aa17.7■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP6D1Q9H9H5 199 aa17.7■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa17.69■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MDFICQ9P1T7 246 aa17.69■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OTOGQ6ZRI0 2925 aa17.69■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BMM0 161 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2D1P51668 147 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EMP1P54849 157 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCGB1D4Q6XE38 83 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9orf85Q96MD7 179 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SDHAF1A6NFY7 115 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM141Q96I45 108 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM17AQ99595 171 aa17.68■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM238C9JI98 176 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE13Q4V321 117 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH2D6Q7Z4S9 175 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIR2DL4Q99706 377 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa17.67■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F5H697 171 aa17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ETDBQ3ZM63 59 aa17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1CP0DJD4 496 aa17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTURNQ8N3F0 131 aa17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0J9YY99 117 aa17.65■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa17.65■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A6NJY4 79 aa17.65■□□□□ 0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPEAR-AS2P59090 65 aa17.64■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERVK_113P61574 105 aa17.64■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF876PQ49A33 203 aa17.64■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNRF2Q8NHG8 242 aa17.64■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HTN1P15515 57 aa17.63■□□□□ 0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms