RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF479Q96JC4 524 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TAL2Q16559 108 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.16□□□□□ -0.94
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM231CP0DMU5 169 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.13□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 PROK1P58294 105 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01619G3V211 115 aa9.13□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01549A6NIU2 74 aa9.12□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.12□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.1□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIGMAR1Q99720 223 aa9.09□□□□□ -0.95
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NACAE9PAV3 2078 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD28P10747 220 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ACANP16112 2415 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
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