RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		A8MTW9	85 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		P0DMU3	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		Q5PR19	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CENPE	Q02224	2701 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	VCX2	Q9H322	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LEPROT	O15243	131 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	POLQ	O75417	2590 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB131A	P59861	70 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N2B8	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM223	A0PJW6	202 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		A8MWV9	139 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559		H3BMM0	161 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	AMELX	Q99217	191 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PRO0461	Q9UI25	63 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBA4	P53673	196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SLURP1	P55000	103 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN13	O95857	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PTH2	Q96A98	100 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2P5	195 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RHOD	O00212	210 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ETDB	Q3ZM63	59 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	APOM	O95445	188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	HTN1	P15515	57 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2D3	P61077	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2D2	P62837	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF415	Q09FC8	603 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	FBN2	P35556	2912 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CFC1B	P0CG36	223 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CFC1	P0CG37	223 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YXV3	536 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CD28	P10747	220 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	CR1	P17927	2039 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM238	C9JI98	176 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB2	P49721	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SPX	Q9BT56	116 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	MTURN	Q8N3F0	131 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01587	Q99440	93 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SIGMAR1	Q99720	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms