RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TMUB2Q71RG4 321 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ASB13Q8WXK3 278 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CARD19Q96LW7 228 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ATP5SQ99766 215 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ACOT13Q9NPJ3 140 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 P01737 135 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MT2AP02795 61 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SELENOTP62341 195 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SMCO1Q147U7 214 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DNAL1Q4LDG9 190 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 LYZL2Q7Z4W2 148 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 S100A7AQ86SG5 101 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RNF24Q9Y225 148 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PRELID1Q9Y255 219 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RBAKDNA6NC62 111 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 A8MWV9 139 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 GOSR2O14653 212 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF861PO60384 105 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MT1FP04733 61 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 GZMBP10144 247 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PRSS3P35030 304 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MXD1Q05195 221 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 LHFPL1Q86WI0 220 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TVP23CQ96ET8 276 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DIRAS2Q96HU8 199 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf16Q9BUW7 83 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 NAA60Q9H7X0 242 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0A6YYH2 397 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 A6NJ64 397 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 FAM74A7A6NL05 159 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 K7EQM0 130 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 AKR1C4P17516 323 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2BP63146 152 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SYCNQ0VAF6 134 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 GPX8Q8TED1 209 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 WFDC1Q9HC57 220 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 FGF6P10767 208 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SDC2P34741 201 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SULT1A2P50226 295 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 S100A10P60903 97 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MIC13Q5XKP0 118 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 ZFAND1Q8TCF1 268 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MGST2Q99735 147 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DERL1Q9BUN8 251 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GVG6 124 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 K7EPK0 472 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SYNGR2O43760 224 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CD3DP04234 171 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PKIAP61925 76 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 Q6Q795 121 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 OR51S1Q8NGJ8 323 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TERB2Q8NHR7 220 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PTH2Q96A98 100 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms