RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PAXX	Q9BUH6	204 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		E9PLD3	99 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CT45A10	P0DMU9	189 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	GNG5	P63218	68 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR82	Q96P67	336 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CELA1	Q9UNI1	258 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		X6R8D5	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	NACA	E9PAV3	2078 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		P01737	135 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	MUC7	Q8TAX7	377 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	C18orf15	Q96N68	181 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	EPDR1	Q9UM22	224 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	GCSH	P23434	173 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	FXYD2	P54710	66 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ETDB	Q3ZM63	59 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PRR9	Q5T870	116 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		Q9H3A6	140 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PSG8	Q9UQ74	426 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GW15	77 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	IGLL5	B9A064	214 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	CASC10	Q5T4H9	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		Q8NAQ8	132 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A096LNJ9	63 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PGP	A6NDG6	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	RIG	Q13278	110 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	FMC1	Q96HJ9	113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	PRO0461	Q9UI25	63 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FAM227B-208	ENST00000559573	LTA	P01374	205 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	NMU	P48645	174 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CACNG7	P62955	275 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	GAGE5	Q13069	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	GAGE6	Q13070	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GUT8	65 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	TAL2	Q16559	108 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	CEND1	Q8N111	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BMG7	143 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		K7ERJ3	54 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	FOXI1	Q12951	378 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		Q6ZTC4	211 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01587	Q99440	93 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	VCX2	Q9H322	139 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	APOM	O95445	188 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	HBD	P02042	147 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	HTN3	P15516	51 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		Q6ZUT4	128 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	SYT8	Q8NBV8	401 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GWB2	263 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FAM227B-208	ENST00000559573	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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