RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 NMBP08949 121 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 BCL2P10415 239 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 GNG4P50150 75 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SULT1A2P50226 295 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00315P59091 139 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 HAMPP81172 84 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 OR10J3Q5JRS4 329 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SLC51BQ86UW2 128 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 BAGE2Q86Y30 109 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 PARLQ9H300 379 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 MED9Q9NWA0 146 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 PRO0255Q9UI72 69 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 LECT2O14960 151 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SIVA1O15304 175 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 RS1O15537 224 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 TDRG1Q3Y452 100 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 RNF212Q495C1 297 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZR54 194 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf223Q8N319 242 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 FAM210BQ96KR6 192 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 SPXQ9BT56 116 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 Q9H8V8 135 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 PKD1P98161 4303 aa2.91□□□□□ -1.94
TMOD3-204ENST00000558666 K7EN84 100 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV2-8P01709 118 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RHOHQ15669 191 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ZFP82Q8N141 532 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RASL10AQ92737 203 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C11orf52Q96A22 123 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PRADC1Q9BSG0 188 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DNAH2Q9P225 4427 aa2.9□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GVY2 172 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 A8MWV9 139 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C16orf90A8MZG2 172 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PSCAO43653 123 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PDE6DO43924 150 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 P01737 135 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 CRYGDP07320 174 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 RAB5CP51148 216 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ADIRFQ15847 76 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TTC32Q5I0X7 151 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 AP1S3Q96PC3 154 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IL36BQ9NZH7 164 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 VAX2Q9UIW0 290 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PKHD1P08F94 4074 aa2.89□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF727A8MUV8 499 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 NCR2O95944 276 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DQA1P01909 254 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM17P0DL12 118 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 EVI2AP22794 236 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01620Q4KN68 170 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 SFRP2Q96HF1 295 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 C18orf15Q96N68 181 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD3-204ENST00000558666 UPK3BQ9BT76 320 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms