RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555700.1

PAPLN-209, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 4,668 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-209ENST00000555700 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.5□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 A0A096LPF7 62 aa9.5□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 H3BMG7 143 aa9.5□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 C20orf173Q96LM9 149 aa9.5□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 E9PLD3 99 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PRSS47A8MTI9 375 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 AMTNQ6UX39 209 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 Q9H8V8 135 aa9.49□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF843Q8N446 348 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PCNTO95613 3336 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 CFC1BP0CG36 223 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 CFC1P0CG37 223 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.48□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 C11orf86A6NJI1 115 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 H3BMM0 161 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 NXPH4O95158 308 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.47□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 A0A0J9YY99 117 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PSMB8P28062 276 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 FXYD2P54710 66 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 HERV-K104P63124 156 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 PIFOQ8TCI5 191 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 IFITM1P13164 125 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 UBE2WQ96B02 151 aa9.46□□□□□ -0.89
PAPLN-209ENST00000555700 GYPEP15421 78 aa9.46□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 IGLL5B9A064 214 aa9.46□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 XCL1P47992 114 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 CCL25O15444 150 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.45□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 A0A1W2PPR1 153 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 ATP5G1P05496 136 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 U3KQK5 164 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 TAX1BP3O14907 124 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 INSL3P51460 131 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 C5orf38Q86SI9 138 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.44□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 PSCAO43653 123 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 IGLV1-40P01703 118 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 Q6ZSV7 163 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 LRRK2Q5S007 2527 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 ADAMTS20P59510 1910 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 A4D1N5 150 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 RNF185Q96GF1 192 aa9.43□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.42□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.42□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.42□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 Q6ZQT7 251 aa9.42□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 ZNF702PQ9H963 129 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 CRLF1O75462 422 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 Q6ZS46 218 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 JMJD1CQ15652 2540 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 CARD19Q96LW7 228 aa9.41□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.4□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PAPLN-209ENST00000555700 AVPP01185 164 aa9.4□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.39□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 SOCS3O14543 225 aa9.39□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 DEFB135Q30KP9 77 aa9.39□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 KLLNB2CW77 178 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 CNFNQ9BYD5 112 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 P0DMU3 169 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 FAM231AP0DMU4 169 aa9.38□□□□□ -0.91
PAPLN-209ENST00000555700 FAM231CP0DMU5 169 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms