RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 CXCL5P42830 114 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N6K4 173 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 ODF3Q96PU9 254 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1B-217ENST00000541869 K7EMI3 77 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 TDRG1Q3Y452 100 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 PRAC2D3DTV9 90 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 MED14OSP0DP75 135 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 ACANP16112 2415 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZTI0 123 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 V9GYV3 84 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GWB2 263 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 CXCL1P09341 107 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 UTF1Q5T230 341 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BKO60814 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BJP06899 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BOP23527 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BBP33778 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BDP58876 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BCP62807 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 FGF6P10767 208 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV1-40P01703 118 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 IGLC2P0DOY2 106 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 MORN5Q5VZ52 161 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 STPG4Q8N801 248 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N976 141 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 NPYP01303 97 aa7.74□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB1P60022 68 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HERV-K104P63124 156 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 G3V4G9 280 aa7.73□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 P0C879 139 aa7.73□□□□□ -1.17
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POLR1B-217ENST00000541869 CCL25O15444 150 aa7.72□□□□□ -1.17
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POLR1B-217ENST00000541869 REG3AQ06141 175 aa7.72□□□□□ -1.17
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POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GV72 72 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 CTAG1AP78358 180 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 DDTP30046 118 aa7.72□□□□□ -1.17
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POLR1B-217ENST00000541869 HSD52Q0P140 79 aa7.72□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFS5O43920 106 aa7.71□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV1-51P01701 117 aa7.71□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK8P0C7L1 97 aa7.71□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.71□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf85Q96MD7 179 aa7.71□□□□□ -1.17
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.71□□□□□ -1.18
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POLR1B-217ENST00000541869 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.71□□□□□ -1.18
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POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.71□□□□□ -1.18
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POLR1B-217ENST00000541869 RETNQ9HD89 108 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 CARD19Q96LW7 228 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 MDFICQ9P1T7 246 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 MUC7Q8TAX7 377 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.7□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 K7ERU9 68 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 BRI3O95415 125 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.69□□□□□ -1.18
POLR1B-217ENST00000541869 ADAMTS20P59510 1910 aa7.69□□□□□ -1.18
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