RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 HAMPP81172 84 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 SLC51BQ86UW2 128 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 C11orf52Q96A22 123 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 XKRY2A2RUG3 117 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 FAM229AH3BQW9 127 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 P01737 135 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 C1QBP02746 253 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 MGPP08493 103 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 Q0VG73 95 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 WFDC2Q14508 124 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 Q5VSD8 79 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 Q8N976 141 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 AP1S3Q96PC3 154 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 BIN3Q9NQY0 253 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 VAX2Q9UIW0 290 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-222ENST00000540445 IGLV2-8P01709 118 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 CRPP02741 224 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 CACNG7P62955 275 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 SMIM12Q96EX1 92 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 F2Z2F3 143 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 H7C1H1 209 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 BCL2P10415 239 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 PKIAP61925 76 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TRGC1P0CF51 173 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 IGLC6P0CF74 106 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NTF3P20783 257 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 GAGE6Q13070 117 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 MPV17L2Q567V2 206 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 ENHOQ6UWT2 76 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZNX1 250 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 AKAP14Q86UN6 197 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NUDT11Q96G61 164 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 M0QY20 66 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 BLOC1S1P78537 153 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TWIST1Q15672 202 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 LINC01620Q4KN68 170 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 OCC1Q8TAD7 63 aa5.93□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 HLA-DQA1P01909 254 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 CEBPGP53567 150 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 C14orf177Q52M58 125 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 RASL11AQ6T310 242 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 NIT2Q9NQR4 276 aa5.92□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 RBX1P62877 108 aa5.91□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 MIAQ16674 131 aa5.91□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 WDR73Q6P4I2 378 aa5.91□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.91□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 K7EN84 100 aa5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 UBE2L6O14933 153 aa5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 IQCJQ1A5X6 159 aa5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 TMEM243Q9BU79 118 aa5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LMO3-222ENST00000540445 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-222ENST00000540445 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-222ENST00000540445 USP17L23D6RBM5 183 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-222ENST00000540445 TMEM250H0YL14 139 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-222ENST00000540445 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms