RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 H7C1H1 209 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 P0DMU3 169 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 FAM231AP0DMU4 169 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 FAM231CP0DMU5 169 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GYPEP15421 78 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 NIT2Q9NQR4 276 aa8.58□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 COLCA2A8K830 154 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 SCO1O75880 301 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAS8-AS1O95177 125 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.57□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 HLA-DQA1P01909 254 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 PPBPP02775 128 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 MT-ND6P03923 174 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 UBE2D3P61077 147 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 UBE2D2P62837 147 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 NRACQ8N912 160 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAGE12JA6NER3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 PPP1R17O96001 155 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 TIRAPP58753 221 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAGE1Q13065 139 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAGE4Q13068 117 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAGE5Q13069 117 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 GAGE13Q4V321 117 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 SMKR1H3BMG3 65 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 PHOX2AO14813 284 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 NUDT3O95989 172 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 APCSP02743 223 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 SRIP30626 198 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 CKS2P33552 79 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 PRSS47A8MTI9 375 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 D6R8Y8 96 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ESRGQ1W209 222 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ORMDL3Q8N138 153 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 C20orf78Q9BR46 151 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-217ENST00000537757 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.53□□□□□ -1.04
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LMO3-217ENST00000537757 NCR2O95944 276 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.52□□□□□ -1.05
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LMO3-217ENST00000537757 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.51□□□□□ -1.05
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LMO3-217ENST00000537757 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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LMO3-217ENST00000537757 ST20Q9HBF5 79 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 NPYP01303 97 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 VCYO14598 125 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 CCL18P55774 89 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 UPK3BQ9BT76 320 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.48□□□□□ -1.05
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LMO3-217ENST00000537757 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 LELP1Q5T871 98 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 DNAH2Q9P225 4427 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 KMT2AQ03164 3969 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 TRGC2P03986 189 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 IQCJQ1A5X6 159 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 RYR2Q92736 4967 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-217ENST00000537757 TSHBP01222 138 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-217ENST00000537757 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-217ENST00000537757 PMCHP20382 165 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-217ENST00000537757 COTL1Q14019 142 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-217ENST00000537757 Q8N8P6 123 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-217ENST00000537757 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.45□□□□□ -1.06
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